Originea evreilor din estul Europei a fost dezvaluita de polimorfismele autosomale, cromozomiale sexuale si mtDNA

• Acces 40k

• 11 referinte

• 63 Altmetric

• Detalii metrice

fundal

Acest studiu isi propune sa stabileasca originea probabila a EEJ (evreii din Europa de Est) prin analiza genetica la distanta a markerilor autosomali si a haplogrupurilor pe cromozomii X si Y si mtDNA.

Rezultate

Conform polimorfismelor autosomale, populatiile evreiesti investigate nu au o origine comuna, iar EEJ este mai aproape de italieni in special si de europeni in general decat de celelalte populatii evreiesti. Asemanarea EEJ cu italienii si europenii este, de asemenea, sustinuta de haplogrupurile cromozomiale X. Spre deosebire de haplogrupurile Y-cromozomiale, EEJ sunt cele mai apropiate de populatiile non-evreiesti din estul Mediteranei. MtDNA prezinta un model mixt, dar, in general, EEJ sunt mai indepartate de majoritatea populatiilor si detin o pozitie marginala decat una centrala. Matricea genetica autosomala la distanta are o corelatie foarte mare (0,789) cu geografia, in timp ce matricele X-cromozomiale, Y-cromozomiale si mtDNA au o corelatie mai mica (0,540, 0,395 si, respectiv, 0,641).

concluzii

Asemanarea genetica stransa cu italienii concorda cu prezumtia istorica potrivit careia evreii Ashkenazi au inceput migratiile in Europa in Italia si cu dovezi istorice ca convertirea la iudaism era comuna in Roma antica. Sunt discutate motivele discrepantei dintre markerii biparentali si markerii uniparentali.

examinatori

Acest articol a fost revizuit de Damian Labuda (nominalizat de Jerzy Jurka), Kateryna Makova si Qasim Ayub (nominalizat de Dan Graur).

Afinitatile genetice ale populatiilor evreiesti au fost studiate inca din primele zile ale geneticii, cu toate acestea, originea acestor populatii este inca obscura. Unele studii, incercand sa stabileasca originile populatiilor evreiesti cu markeri autosomali, au sustinut ca populatiile evreiesti au o origine comuna, dar altii au concluzionat ca evreii sunt un grup foarte divers. Acest corp de studii a fost deja revizuit critic [1].

Originea evreilor din Europa de Est (EEJ), de departe cea mai mare si mai importanta populatie Ashkenazi, si afinitatile lor fata de alte populatii evreiesti si europene nu sunt inca rezolvate. Studiile care le-au comparat prin analiza la distanta genetica a markerilor autosomali fata de populatiile mediteraneene europene au relevat faptul ca acestia sunt mai apropiati de europeni decat de alte populatii evreiesti [1–3].

EEJ este cea mai mare si cea mai investigata comunitate evreiasca, cu toate acestea istoria lor ca evreie franco-germana este cunoscuta la noi abia de la aparitia lor in secolul al IX-lea si migratia lor ulterioara cateva sute de ani mai tarziu in Europa de Est [4, 5]. De unde au venit acesti evrei? Se pare ca au venit in Germania si Franta din Italia [5–8]. Este, de asemenea, posibil ca unii evrei sa migreze spre nord din coloniile italiene de pe malul nordic al Marii Negre [9]. Toti acesti evrei sunt probabil descendentii prozelitelor. Conversia la iudaism a fost comuna in Roma in primele secole i.Hr. si d.Hr. Iudaismul a castigat multi adepti printre toate randurile Societatii Romane [10-13].

Scopul acestui studiu este de a stabili originea probabila a acestei populatii evreiesti majore, folosind un set de date mai mare de markeri autosomali si de a compara rezultatele cu analizele bazate pe datele disponibile pentru cromozomii X si Y si pentru mtDNA.

Sase populatii evreiesti: EEJ, evrei marocani, evrei irakieni. In analiza sunt inclusi evreii iranieni, evreii yemeniti si evreii etiopieni, care au fost studiati pentru toti markerii autosomali folositi in acest studiu. EEJ sunt definite pe baza istoriei ca acei evrei originari din zonele Regatului Polon-Lituan si descendentii acestora in regiuni limitrofe, cuprinzand teritoriile Rusiei, Poloniei, Statelor Baltice, Belarusului, Moldovei, Moldovei (nord-estul o parte din Romania) si Ucraina. Datele privind markerii non-autosomali au fost de asemenea disponibile pentru alte populatii evreiesti: evrei bulgari (X, mtDNA), evrei turci (X, mtDNA), evrei tunisieni (mtDNA), evrei libieni (Y, mtDNA) si evrei Djerban (Y ).

Saptesprezece markeri autosomali sunt: ​​AK, ADA, PGM1, PGD, ACP, ESD, GPT, HP, GC, J311 MspI si MetH TaqI (ambii pe cromozomul 7 in apropierea locului CF), FV G1691A, FII G20210A, MTHFR C677T, CBS 844ins68, ACE ID si PAH XmnI. Toti markerii sunt unici-eveniment-polimorfisme si in afara de doua insertii (CBS 844ins68, ACE ID) sunt toate SNP-uri. Primii noua markeri sunt polimorfisme ale enzimelor celulelor rosii si ale proteinelor serice si au fost tipizate mai ales prin electroforeza proteica, dar variatia la nivel de proteine ​​este direct legata in mod 1: 1 de variatia SNP la nivelul ADN-ului. Intr-adevar, unele dintre rezultatele populatiilor evreiesti au fost obtinute prin metode PCR [1, 14]. Polimorfismul celor opt markeri ramasi poate fi detectat doar la nivelul ADN-ului. J311 MspI si MetH TaqI au fost dactilografiate in toate populatiile, inclusiv in populatiile israeliene (rezultate nepublicate) prin sudarea si hibridizarea Sudului [15, 16]. Ceilalti 6 markeri au fost tastati in populatiile israeliene prin metode PCR. Datele despre FV G1691A, FII G20210A, MTHFR C677T si CBS 844ins68 au fost deja publicate [3, 17]. Datele despre ACE ID si PAH XmnI sunt inca nepublicate. Aceste polimorfisme au fost tipizate in conformitate cu metodele lui Rigat si colab. [18] si Goltsov si colab. [19] respectiv. Frecventele de alele pentru toate populatiile sunt date in fisierul suplimentar 1: tabelele S1-4. Tabelul S2 (fisierul suplimentar 1) prezinta patru markeri de ambele parti ale locusului CF. Datorita legaturii dintre ele, am ales sa folosesc doar cei doi dintre cei mai distali markeri, care sunt separati de cativa centimorgani.

Gower (citata in [20]) recomanda ca, pentru studiile microevolutionale, cand marimile esantionului sa fie destul de variabile si frecventele genice sa nu difere foarte mult, G2 de la Sanghvi [21] ar fi cea mai potrivita, iar aceasta este masura pe care am folosit-o. Distantele au fost, de asemenea, calculate cu formula [22] a lui Nei si rezultatele au fost foarte similare (r = 0,990, nu este prezentata matricea genetica a distantei). Arborele vecin care s-a alaturat a fost calculat de PHYLIP 3.66. Intrucat nu calculeaza G2 lui Sanghvi, am folosit Reynolds si colab. distanta [23], care se bazeaza, de asemenea, pe presupunerea ca frecventele genelor se schimba numai prin deriva genetica, numai pentru calculul arborelui (matricea genetica a distantei nu este prezentata). Semnificatia nodurilor din arbore si erorile standard ale distantelor genetice au fost calculate prin bootstrapping de 10.000 de ori. Graficele multidimensionale de scalare si testele Mantel pentru corelatia dintre matricile genetice ale distantei si intre ele si matricile distantelor geografice au fost calculate prin NTSYS 1.70. Distantele geografice au fost calculate ca distante mari de cerc intre capitalele tarilor de origine ale populatiilor (Varsovia a fost aleasa pentru EEJ). Semnificatia testului Mantel a fost evaluata prin 10.000 permutari.

Distantele genetice autosomale (tabelul 1) nu arata nicio asemanare deosebita intre populatiile evreiesti. EEJ sunt mai aproape de italieni in special si de europeni in general decat de celelalte populatii evreiesti. Toate distantele, in afara de una, difera de la zero cu mai mult de doua ori eroarea lor standard. O diferenta intre doua distante poate fi considerata semnificativa, daca este mai mult de doua ori cea mai mare eroare standard. Diferentele dintre distanta EEJ fata de italieni si distantele lor fata de celelalte populatii evreiesti sunt semnificative in conformitate cu acest criteriu si acelasi lucru este valabil si pentru toate populatiile neevreice, cu exceptia grecilor si rusilor. De fapt, distanta dintre EEJ si italieni este cea mai mica distanta din matrice. O diagrama de scalare multidimensionala a matricei distantei genetice (figura 1) surprinde apropierea EEJ de italieni si alte populatii europene. Acelasi lucru este valabil si pentru vecinul care se alatura copacului (figura 2). Trebuie remarcat faptul ca comploturile de scalare multidimensionale sunt o modalitate de a prezenta grafic relatiile complexe ale matricilor genetice la distanta. Ca atare, acestea sunt neaparat mai putin precise decat matricile pe care se bazeaza. Pentru a intelege afinitatile genetice ale unei anumite populatii, trebuie sa se examineze distantele sale in matricea insasi, nu in complot. Acelasi lucru este valabil si pentru vecinul care se alatura. Valorile bootstrap-ului indica robustetea gruparii, dar nu si semnificatia distantelor genetice individuale. Acelasi lucru este valabil si pentru vecinul care se alatura copacului (figura 2). Trebuie remarcat faptul ca comploturile de scalare multidimensionale sunt o modalitate de a prezenta grafic relatiile complexe ale matricilor genetice la distanta. Ca atare, acestea sunt neaparat mai putin precise decat matricile pe care se bazeaza. Pentru a intelege afinitatile genetice ale unei anumite populatii, trebuie sa se examineze distantele sale in matricea insasi, nu in complot. Acelasi lucru este valabil si pentru vecinul care se alatura. Valorile bootstrap-ului indica robustetea gruparii, dar nu si semnificatia distantelor genetice individuale. Acelasi lucru este valabil si pentru vecinul care se alatura copacului (figura 2). Trebuie remarcat faptul ca comploturile de scalare multidimensionale sunt o modalitate de a prezenta grafic relatiile complexe ale matricilor genetice la distanta. Ca atare, acestea sunt neaparat mai putin precise decat matricile pe care se bazeaza. Pentru a intelege afinitatile genetice ale unei anumite populatii, trebuie sa se examineze distantele sale in matricea insasi, nu in complot. Acelasi lucru este valabil si pentru vecinul care se alatura. Valorile bootstrap-ului indica robustetea gruparii, dar nu si semnificatia distantelor genetice individuale. Ca atare, acestea sunt neaparat mai putin precise decat matricile pe care se bazeaza. Pentru a intelege afinitatile genetice ale unei anumite populatii, trebuie sa se examineze distantele sale in matricea insasi, nu in complot. Acelasi lucru este valabil si pentru vecinul care se alatura. Valorile bootstrap-ului indica robustetea gruparii, dar nu si semnificatia distantelor genetice individuale. Ca atare, acestea sunt neaparat mai putin precise decat matricile pe care se bazeaza. Pentru a intelege afinitatile genetice ale unei anumite populatii, trebuie sa se examineze distantele sale in matricea insasi, nu in complot. Acelasi lucru este valabil si pentru vecinul care se alatura. Valorile bootstrap-ului indica robustetea gruparii, dar nu si semnificatia distantelor genetice individuale.

Haplogrupurile X-cromozomiale demonstreaza aceeasi legatura intre EEJ si italienii si alti europeni (tabelul 2, figura 3). In schimb, conform haplogrupurilor Y-cromozomiale EEJ sunt cele mai apropiate de populatiile non-evreiesti din estul Mediteranei (tabelul 3, figura 4). MtDNA prezinta un model mixt in care EEJ este aproximativ la fel de aproape de evreii marocani, palestinieni, italieni si evrei bulgari, dar, in general, sunt mai indepartate de majoritatea populatiilor si detin o pozitie marginala in complotul MDS, mai degraba decat una centrala ca in celelalte parcele. (tabelul 4, figura 5).

Corelatiile dintre distanta genetica si geografia si intre matricile genetice ale distantei bazate pe diferiti markeri (cu exceptia populatiilor necaucasoide etiopiene si evrei etiopieni) sunt prezentate in tabelul 5. Polimorfismele autosomice au o corelatie foarte mare (0,789) cu geografia, in contrast cu corelatii mai moderate ale polimorfismelor X-cromozomiale, Y-cromozomiale si mtDNA (0,540, 0,395, respectiv 0,641). Pentru a compara doua teorii concurente cu privire la originea EEJ, distantele geografice ale acestora au fost calculate ca si cum ar fi originare din Italia sau Israel, adica distantele mari ale cercului pentru EEJ au fost calculate nu intre Varsovia si alte capitale, ci intre Roma sau Ierusalim si altele capitale. Corelatia dintre distanta genetica autosomala si geografia a fost usor mai mare, 0,804, pentru Roma, dar a scazut la 0,694 pentru Ierusalim. Distantele autosomale sunt mult mai bine corelate cu distantele mtDNA (0,826) si cu distantele X-cromozomiale (0,732) decat cu distantele Y-cromozomiale (0,437). Corelatiile dintre mtDNA si matricele cromozomiale X si matricea Y-cromozomiala sunt destul de slabe (0,206, respectiv 0,241) si nesemnificative. Cand corelatiile cu geografia au fost calculate doar pentru distantele genetice ale EEJ si nu pentru intreaga matrice (tabelul 6), aceleasi tendinte apar cu corelatia autosomala de la Roma atingand un nivel de 0,926. Corelatiile din Ierusalim sunt negative pentru autosomi, cromozomul X si ADNm. Reversul este valabil pentru cromozomul Y. 732) decat cu distantele Y-cromozomiale (0,437). Corelatiile dintre mtDNA si matricele cromozomiale X si matricea Y-cromozomiala sunt destul de slabe (0,206, respectiv 0,241) si nesemnificative. Cand corelatiile cu geografia au fost calculate doar pentru distantele genetice ale EEJ si nu pentru intreaga matrice (tabelul 6), aceleasi tendinte apar cu corelatia autosomala de la Roma atingand un nivel de 0,926. Corelatiile din Ierusalim sunt negative pentru autosomi, cromozomul X si ADNm. Reversul este valabil pentru cromozomul Y. 732) decat cu distantele Y-cromozomiale (0,437). Corelatiile dintre mtDNA si matricele cromozomiale X si matricea Y-cromozomiala sunt destul de slabe (0,206, respectiv 0,241) si nesemnificative. Cand corelatiile cu geografia au fost calculate doar pentru distantele genetice ale EEJ si nu pentru intreaga matrice (tabelul 6), aceleasi tendinte apar cu corelatia autosomala de la Roma atingand un nivel de 0,926. Corelatiile din Ierusalim sunt negative pentru autosomi, cromozomul X si ADNm. Reversul este valabil pentru cromozomul Y. Cand corelatiile cu geografia au fost calculate doar pentru distantele genetice ale EEJ si nu pentru intreaga matrice (tabelul 6), aceleasi tendinte apar cu corelatia autosomala de la Roma atingand un nivel maxim de 0,926. Corelatiile din Ierusalim sunt negative pentru autosomi, cromozomul X si ADNm. Reversul este valabil pentru cromozomul Y. Cand corelatiile cu geografia au fost calculate doar pentru distantele genetice ale EEJ si nu pentru intreaga matrice (tabelul 6), aceleasi tendinte apar cu corelatia autosomala de la Roma atingand un nivel de 0,926. Corelatiile din Ierusalim sunt negative pentru autosomi, cromozomul X si ADNm. Reversul este valabil pentru cromozomul Y.

Analiza distantei genetice autosomale prezentata aici demonstreaza clar ca populatiile evreiesti investigate nu au o origine comuna. Asemanarea EEJ cu italienii si alte populatii europene le prezinta ca o populatie europeana autohtona. Un studiu efectuat intr-un colegiu din New York in anii 1920 a aratat aceeasi similitudine Ashkenazi – italiana pe baza caracteristicilor fizice. Primii ani au fost solicitati inainte sa se cunoasca unii pe altii pentru a indica originea colegilor lor de studiu. Patru procente din italieni au fost considerati evrei Ashkenazi, iar acelasi procent din evreii Ashkenazi au fost judecati italieni [24]. EEJ par sa aiba in principal origine italiana (romana), ceea ce este usor de inteles, avand in vedere dovezile istorice prezentate mai sus.

Corelatia ridicata intre distantele genetice autosomale si geografie si corelatia redusa atunci cand se ia EEJ sa provina din Tara Israelului consolideaza originea europeana a EEJ. De fapt, corelatia markerilor autosomali cu geografia este mai mare decat a fost descrisa anterior pentru 49 de markeri clasici (0,503) sau ~ 300,000 SNP autosomali (0,661) in Europa [25]. Daca pentru comparatie, sunt incluse doar populatii europene non-evreiesti, corelatia este mai mica, 0,689, dar inca mai mare decat corelatiile mentionate mai sus. De asemenea, este interesant de mentionat modul in care utilizarea celor trei alternative geografice pentru EEJ modifica corelatia, atunci cand sunt incluse doar populatii europene. Corelatia ramane aproape aceeasi, 0,679, pentru Roma, dar scade la 0,490 si 0,571 pentru Varsovia si, respectiv, pentru Ierusalim;

Markeri biparentali sau uniparentali

La prima vedere, se pare ca exista mai multe explicatii pentru rezultatele diferite produse prin analiza haplogrupurilor NRY. Se pare ca este posibil ca populatia fondatorilor EEJ la Roma sa fie compusa din barbati israeliti exilati si femele romane locale. In forma sa simpla, aceasta contrazice clar faptele, deoarece atat polimorfismele autosomale cat si cele X-cromozomiale demonstreaza ca EEJ nu ocupa o pozitie intermediara intre populatiile europene si Orientul Mijlociu, ci mai degraba una stricta europeana. Din tabelul 1 este clar ca italienii sunt la fel de apropiati sau mai apropiati de celelalte populatii evreiesti si palestinieni ca EEJ. Este posibil ca odata ce populatia fondatoare a fost stabilita, nu s-au alaturat alti barbati, dar multe femei, creand astfel o populatie aproape in intregime europeana in toate aspectele genetice, in afara de cromozomii Y. Un astfel de fenomen a fost descris pentru populatia din Antioquia, Columbia, unde autosomii indica 79% din stramosii europeni si doar 16% din stramosii amerindieni, in timp ce, conform mtDNA, stramosii sunt 90% amerindieni si doar 2% europeni (exista si un componenta mica africana). Inregistrarile istorice demonstreaza ca femelele amerindiene locale s-au alaturat populatiei abia la inceput, in timp ce barbatii europeni s-au alaturat si ei in perioadele ulterioare [26]. Sugestia conform careia stramosii prozelite ai EEJ erau aproape in totalitate femei nu este in acord cu ceea ce stim despre convertirea la iudaism [10, 12, 27–29]. in timp ce, conform ADNm, stramosii sunt 90% amerindieni si doar 2% europeni (exista si o mica componenta africana). Inregistrarile istorice demonstreaza ca femelele amerindiene locale s-au alaturat populatiei abia la inceput, in timp ce barbatii europeni s-au alaturat si ei in perioadele ulterioare [26]. Sugestia conform careia stramosii prozelit ai EEJ erau aproape in totalitate femei nu este totusi in acord cu ceea ce stim despre convertirea la iudaism [10, 12, 27–29]. in timp ce, conform ADNm, stramosii sunt 90% amerindieni si doar 2% europeni (exista si o mica componenta africana). Inregistrarile istorice demonstreaza ca femelele amerindiene locale s-au alaturat populatiei abia la inceput, in timp ce barbatii europeni s-au alaturat si ei in perioadele ulterioare [26]. Sugestia conform careia stramosii prozelite ai EEJ erau aproape in totalitate femei nu este in acord cu ceea ce stim despre convertirea la iudaism [10, 12, 27–29].

Inferenta ca NRY indica o origine a Orientului Mijlociu a EEJ este eronata nu numai pentru ca analiza cromozomiala Y contrazice analizele bazate pe ceilalti cromozomi si pentru ca NRY este un singur marker uniparental care nu reprezinta intreaga istorie a populatiei , dar si datorita faptului ca marimea sa efectiva mai mica a populatiei o face mult mai vulnerabila la deriva genetica severa cauzata de blocajele demografice. Istoriile demografice ale trei populatii evreiesti exemplifica modul in care tiparele demografice diferite fac ca markerii uniparentali sa fie mai fiabili pentru evreii irakieni (babilonieni) si evreii yemeniti si mai putin fiabili pentru EEJ. Atat evreii yemeniti, cat si evreii irakieni seamana cu populatii din regiunile lor de origine, conform markerilor autosomali [1, 3, 30–32]. Evreii yemeniti, care sunt de obicei considerati un izolat mic, erau suficient de numeroase pentru a avea un regat independent in primele secole d.Hr. [33]. Au numarat cateva sute de mii in secolul al XII-lea d.Hr. si au scazut treptat; ajungand doar la aproximativ 30-40.000 la inceputul secolului XX [34]. Evreii babilonieni au numarat mai mult de un milion in primul secol d.Hr. [35] si au constituit majoritatea populatiei din zona dintre Eufrat si Tigris in secolele II-III d.Hr. [36]. Gilbert [37] estimeaza ca pana in 600 d.Hr., in Mesopotamia erau 806.000 de evrei, iar conform lui Sassoon [38], a fost locuit de aproximativ un milion de evrei in secolul al VII-lea. In secolul al XIV-lea, estimarile numai pentru Bagdad variaza de la 70.000 la sute de mii [38]. Pana in 1939, cu 11 ani inainte de emigrarea lor, in Irak erau 91.000 de evrei [35]. In contrast, populatia evreiasca din Regatul Polon-Lituanian (EEJ) a trecut prin procesul opus. Istoricul lor este unul dintre efectele fondatorilor, migratii, blocaje demografice si in final o expansiune rapida. Nu stim nimic despre numarul lor in primul mileniu, dar dupa emigrarea lor din Italia in Europa de Vest, se estimeaza ca au numarat 4.000 in 1000 si 20.000 o suta de ani mai tarziu [8]. In 1500, deja in Europa de Est, numarau 10.000-30.000, in 1648 230.000-450.000 si in 1764 750.000 [39–41]. In secolul al XIX-lea, din cauza despartirilor din Regatul Polon-Lituan si a imigratiilor evreilor in Europa Centrala si de Vest si in America, estimarea numarului de EEJ devine mai dificila, dar nu exista nici o indoiala ca cresterea numarului a fost impresionanta , intrucat numarul EEJ, sub conducerea rusa, a fost de 5.200,

Existenta blocajelor demografice severe in istoria EEJ a fost sugerata si de studii genetice ale mutatiilor provocatoare de boli si ale ADNm [42-46]. Comparatia bazata pe acest al doilea marker uniparental, mtDNA, poate ajuta la rezolvarea din genetica insasi a problemei fiabilitatii cromozomului Y pentru a deduce originea stramosilor barbati ai EEJ. Daca contributiile europene si din Orientul Mijlociu la grupul genic al EEJ au fost, respectiv, femei si barbati, atunci comparatiile bazate pe mtDNA trebuie sa plaseze EEJ in randul altor populatii europene, indepartate de populatiile din Orientul Mijlociu. Analiza mtDNA prezentata in acest studiu nu plaseaza EEJ in randul altor populatii europene, ci pozitia lor este mai intermediara si marginala, asa cum se poate observa in figura 5 si in figura 6, unde distantele autosomale sunt corelate cu distantele mtDNA.

Datele despre cromozomul Y in sine sustin, de asemenea, lipsa de fiabilitate a markerilor uniparentali pentru descoperirea originii EEJ. Nebel si colab. [47] a studiat haplogrupul R-M17, a carui frecventa este de ~ 12% la evreii Ashkenazi. Comparand structura retelei STR intre diferitele populatii Ashkenazi si intre diferitele populatii europene non-evreiesti, au ajuns la concluzia ca un singur fondator masculin a introdus acest haplogrup in evreii Ashkenazi in primul mileniu. Behar si colab. [48] ​​scrie „Este izbitor faptul ca, in timp ce populatiile Ashkenazi sunt mai diverse din punct de vedere genetic atat la nivelul SNP, cat si la cel al STR, in comparatie cu omologii lor europeni care nu sunt evrei, au redus foarte mult variabilitatea STR-haplogroup … Acest tip de contrast al diversitatii in populatiile Ashkenazi este o dovada a reducerii dimensiunii efective a populatiei masculine, posibil rezultat dintr-o serie de evenimente fondatoare si rate ridicate de endogamie in Europa. Aceasta dimensiune redusa efectiva a populatiei poate explica incidenta ridicata a mutatiilor bolii fondatorului, in ciuda nivelurilor ridicate generale ale diversitatii NRY “. Este putin probabil ca EEJ sa fie descendentii unei singure populatii. Amestecul impreuna cu dimensiunea efectiva mica a populatiei si blocajele pot crea situatia nedumeritoare. intalnim in markerii uniparentali. Astfel, contributii mai mici din partea mai multor populatii, inclusiv a populatiei evreiesti originale din Orientul Mijlociu,

Comentarii la studii anterioare

Unele studii anterioare bazate pe markeri autosomali clasici au concluzionat ca EEJ este o populatie din Orientul Mijlociu, cu afinitati genetice fata de alte populatii evreiesti. Problemele cu aceste studii au fost anterior discutate in detaliu [1]. Aceste studii au folosit mai putini markeri (in mare parte markeri antigenici mai putin fiabili) si nu au reusit sa includa populatiile mediteraneene europene, in afara de analiza discriminanta a lui Carmelli si Cavalli-Sforza [49], care a folosit doar patru markeri si care contrazice rezultatele ulterior mai elaborate. analiza discriminanta [1] si analiza genetica la distanta a lui Livshits si colab. [32], care include o singura populatie mediteraneana europeana, Spania. In ciuda acestui lucru, atunci cand a fost efectuata o analiza genetica la distanta, similitudinea mai mare a EEJ cu rusii si intr-o masura mai mica cu germanii mai mult decat cu evreii non-europeni a fost evidenta [32]. De fapt, rusii erau mai asemanati cu EEJ decat cu orice populatie europeana non-evreiasca din aceasta analiza.

Recent, Cochran si colab. [50] a folosit 251 de loci autosomali pentru a calcula distantele genetice si a ajuns la concluzia ca „din perspectiva unei mari colectii de variatii genetice in mare masura neutre, Ashkenazimul este in esenta european, nu in Orientul Mijlociu”. Mai recent, mii de SNP-uri au fost folosite de Need et al. [51] pentru a deduce relatiile dintre evreii Ashkenazi si europenii non-evrei si Orientul Mijlociu. Ei au ajuns la concluzia ca evreii Ashkenazi se afla aproximativ la jumatatea distantei dintre europeni si Orientul Mijlociu, ceea ce implica faptul ca evreii Ashkenazi pot contine descendenta mixta din aceste doua regiuni si ca sunt apropiati de populatia Adygei din Caucaz. Cu toate acestea, aceste concluzii sunt nefondate, deoarece au folosit un set de SNP-uri extrem de selectat, care au fost selectate special pentru a face distinctia intre evreii Ashkenazi si alte populatii si au dedus originea evreilor Ashkenazi din analiza componentelor principale (PCA), dar in conformitate cu Tian si colab. [52] arata “Rezultatele PCA depind in mare masura de grupurile de populatie care sunt incluse in analiza. Astfel, ar trebui sa existe o anumita prudenta in interpretarea acestor rezultate si a altor rezultate din metode analitice similare in ceea ce priveste atribuirea originilor anumitor grupuri etnice”. si colab. [52] a publicat, de asemenea, un tabel cu distantele Fst in pereche, bazate pe 10.500 de SNP-uri aleatorii, care demonstreaza ca evreii Ashkenazi nu sunt deloc apropiati de populatia Adygei si, in mod similar cu ceea ce se vede in tabelul 1, distanta lor cea mai mica este de italieni si apoi la greci. Spre deosebire de afirmatia lui Need et al. [51] pe pozitia de la mijloc,

Acelasi fenomen este observat in tabelul distantelor Fst ale Atzmon si colab. [53]. Italienii de Nord (Bergamo si Toscana) sunt putin mai apropiati de populatiile evreiesti si de Orientul Mijlociu decat evreii Ashkenazi. Italienii din Toscana (surprinzator esantionul de la Bergamo nu a fost folosit) in Behar si colab. [54] sunt, de asemenea, mai apropiate de populatiile evreiesti si de Orientul Mijlociu decat evreii Ashkenazi. Italienii din Toscana sunt de fapt cea mai apropiata populatie de evreii Ashkenazi din Behar si colab. [54]. Exista un esantion care pare a fi putin mai aproape, ceea ce ei numesc evrei sefarditi. Din pacate, acest esantion este format din doua populatii, evrei turci si evrei bulgari, care ar fi trebuit studiati separat ca toate celelalte populatii evreiesti. Evreii bulgari s-au aratat in trecut pe baza unor markeri clasici autosomali mai apropiati de EEJ decat de populatiile cu stramosi sefardici si avand in vedere istoria lor, s-a ajuns la concluzia ca componenta askenazi din bazinul lor genic este cel putin la fel de mare sau chiar mai mare decat sefardele. componenta [1]. Atat din studiul actual, cat si din cele ale Atzmon si colab. [53] si Behar si colab. [54] Se poate observa ca singurele populatii evreiesti care sunt la fel de apropiate de evreii Ashkenazi ca si europenii non-evrei sunt cele cu un sefhard semnificativ (Descendentii evreilor care au fost expulzati din peninsula iberica la sfarsitul secolului al XV-lea. ) componenta in grupul de gene. In acest stadiu nu este posibil sa spunem care este sursa acestei asemanari, deoarece nu stim care este originea evreilor sefarditi, dar, luand in considerare toate afinitatile genetice ale ambelor grupuri, acesta provine probabil de la evreii sefardi care sunt descendentii convertitilor in bazinul mediteranean, mai degraba decat de la o origine evreiasca comuna in Tara lui Israel. Cand se compara distantele autosomale ale evreilor EEJ (studiu actual) sau ale evreilor Ashkenazi (in Atzmon et al. [53] si Behar si colab. [54]) de la populatiile evreiesti care au fost cercetate in studiul actual, irakian, iranian, marocan , Evreii yemeniti si etiopieni, se gaseste un acord perfect. Evreii EEJ sau Ashkenazi sunt mult mai apropiati de europenii care nu sunt evrei decat de aceste populatii evreiesti in toate cele trei studii. Atunci cand se compara distantele autosomale ale evreilor EEJ (studiu actual) sau ale evreilor Ashkenazi (in Atzmon et al. [53] si Behar si colab. [54]) de la populatiile evreiesti care au fost cercetate in studiul actual, irakian, iranian, marocan , Evreii yemeniti si etiopieni, se gaseste un acord perfect. Evreii EEJ sau Ashkenazi sunt mult mai apropiati de europenii care nu sunt evrei decat de aceste populatii evreiesti in toate cele trei studii. Cand se compara distantele autosomale ale evreilor EEJ (studiu actual) sau ale evreilor Ashkenazi (in Atzmon et al. [53] si Behar si colab. [54]) de la populatiile evreiesti care au fost cercetate in studiul actual, irakian, iranian, marocan , Evreii yemeniti si etiopieni, se gaseste un acord perfect. Evreii EEJ sau Ashkenazi sunt mult mai apropiati de europenii care nu sunt evrei decat de aceste populatii evreiesti in toate cele trei studii.

Studiile lui Atzmon si colab. [53] si Behar si colab. [54] se bazeaza pe 164.894, respectiv 226.839 SNP. In timp ce acest numar impresionant reduce erorile distantelor care decurg din numarul de markeri, erorile care decurg din esantionarea doar unui numar mic de indivizi sunt mult mai mari in aceste studii, unde marimile esantionului pot fi mici ca 2-4 indivizi. Efectul acestor erori poate fi vazut in tabelul 7. In ciuda numarului mic de markeri, matricea actuala are cea mai mare corelatie cu geografia. Mai mult, are o corelatie mai mare cu fiecare din cele doua celelalte matrice decat cele doua dintre ele. Corelatiile ridicate intre matricea actuala si celelalte doua atesta robustetea distantelor genetice autosomale din acest studiu. Corelatia mai mica intre cele doua matrici, care se bazeaza pe mai mult de 150, 000 de SNP, este surprinzator si cu atat mai mult, daca ne amintim ca cele patru populatii non-evreiesti sunt reprezentate de aceiasi indivizi luati din Panoul Diversitatii Genomului Uman (HGDP). Atunci este probabil ca esantionarea mai multor indivizi, care reprezinta mai mult din variatia populatiilor investigate, sa fie mult mai importanta decat introducerea mai multor markeri. Este, de asemenea, posibil ca ratele de eroare de dactilografie ale studiilor la microarray la nivelul genomului sa fie mult mai mari, asa cum s-a demonstrat erorile de genotipare care au fost descoperite la 7 din 29 (24%) SNP-uri reexaminate [55]. Prin urmare, se pare ca o buna caracterizare a relatiilor genetice intre populatii poate fi obtinuta printr-un numar mic de bune evenimente unice-polimorfisme. daca ne amintim ca cele patru populatii non-evreiesti sunt reprezentate de aceiasi indivizi luati din Panoul de diversitate a genomului uman (HGDP). Atunci este probabil ca esantionarea mai multor indivizi, care reprezinta mai mult din variatia populatiilor investigate, sa fie mult mai importanta decat introducerea mai multor markeri. Este, de asemenea, posibil ca ratele de eroare de dactilografie ale studiilor la microarray la nivelul genomului sa fie mult mai mari, asa cum s-a demonstrat erorile de genotipare care au fost descoperite la 7 din 29 (24%) SNP-uri reexaminate [55]. Prin urmare, se pare ca o buna caracterizare a relatiilor genetice intre populatii poate fi obtinuta printr-un numar mic de bune evenimente unice-polimorfisme. daca ne amintim ca cele patru populatii non-evreiesti sunt reprezentate de aceiasi indivizi luati din Panoul de diversitate a genomului uman (HGDP). Atunci este probabil ca esantionarea mai multor indivizi, care reprezinta mai mult din variatia populatiilor investigate, sa fie mult mai importanta decat introducerea mai multor markeri. Este, de asemenea, posibil ca ratele de eroare de dactilografie ale studiilor la microarray la nivelul genomului sa fie mult mai mari, asa cum s-a demonstrat erorile de genotipare care au fost descoperite la 7 din 29 (24%) SNP-uri reexaminate [55]. Prin urmare, se pare ca o buna caracterizare a relatiilor genetice intre populatii poate fi obtinuta printr-un numar mic de bune evenimente unice-polimorfisme. care reprezinta mai mult din variatia populatiilor cercetate, este mult mai important decat tastarea multor markeri. Este, de asemenea, posibil ca ratele de eroare de dactilografie ale studiilor la microarray la nivelul genomului sa fie mult mai mari, asa cum s-a demonstrat erorile de genotipare care au fost descoperite la 7 din 29 (24%) SNP-uri reexaminate [55]. Prin urmare, se pare ca o buna caracterizare a relatiilor genetice intre populatii poate fi obtinuta printr-un numar mic de bune evenimente unice-polimorfisme. care reprezinta mai mult din variatia populatiilor cercetate, este mult mai important decat tastarea multor markeri. Este, de asemenea, posibil ca ratele de eroare de dactilografie ale studiilor la microarray la nivelul genomului sa fie mult mai mari, asa cum s-a demonstrat erorile de genotipare care au fost descoperite la 7 din 29 (24%) SNP-uri reexaminate [55]. Prin urmare, se pare ca o buna caracterizare a relatiilor genetice intre populatii poate fi obtinuta printr-un numar mic de bune evenimente unice-polimorfisme.

Raportul revizorului 1

Damian Labuda, Departamentul de pediatrie, Centrul de cercetare al Spitalului Sainte-Justine al Universitatii din Montreal, Montreal, PQ Canada (nominalizat de Jerzy Jurka, Institutul de Cercetare a Informatiilor Genetice, Mountain View, California SUA).

Autorul a compilat si reanalizat datele privind polimorfismele cromozomilor autosomali si sexuali colectate de diferite laboratoare pe diferite populatii evreiesti si vest-eurasiatice. Analiza sa indica o componenta europeana mult mai mare a evreilor din Europa de Est, EEJ (in esenta Ashkenazim) decat a altor grupuri evreiesti. Mai mult, analiza indica italienii ca fiind cea mai apropiata populatie de EEJ.

Intrebarea este cum sa interpretezi aceste dovezi. Roma imperiala a fost un oras foarte cosmopolit cultural si genetic divers. In ce masura un esantion de italieni contemporani pastreaza legatura genetica cu populatia sa? Poate reflecta pur si simplu un amestec de influente istorice din diferite centre din jurul Marii Mediterane. Prin urmare, trebuie sa retinem ca conexiunea italiana poate indica pur si simplu legaturi din Europa de Sud si Mediterana cu acestea din urma, inclusiv radacinile din Orientul Mijlociu.

Interesant, aceasta analiza care se bazeaza pe un numar limitat de markeri a furnizat rezultate care sunt foarte asemanatoare cu o lucrare a lui Atzmon si colegii sai, publicata in urma cu cinci zile in Jurnalul American de Genetica Umana si bazata pe genomul genotiparii bazat pe microarray. markere distribuite. As dori ca autorul sa comenteze aceasta lucrare in contextul constatarilor sale si al gandurilor si reflectiilor sale despre originea Diasporei evreiesti. Ar trebui sa ne intoarcem la analizele locusului unic, ca in cazul markerilor transmisi uniparent, dar care vizeaza unul cate unul segmente individuale diferite ale genomului nuclear? Poate ca, in acest fel, am putea imparti si identifica stramosii genetici ai diferitelor populatii, care datorita istoriei lor de izolare relativa, sunt considerati ca omogenici genetic.

Autorul se refera la G2 a lui Sangvi ca la cele mai potrivite valori ale distantei. Ati putea face mai clar cand a fost utilizata aceasta metrica si cand cea a lui Reynolds (numai pentru a produce un copac?).

Raspunsul autorului

Sursele istorice enumerate mai sus arata ca conversia la iudaism a fost comuna in Roma antica printre toate randurile societatii romane, inclusiv familiile imperiale. Prin urmare, este putin probabil ca populatia romana originala sa nu constituie o parte semnificativa a prozelitelor. Ce altceva poate explica asemanarea EEJ cu un esantion general de italieni in acest studiu si cu mai multe esantioane locale in cele doua studii matrice [53, 54]? In toate cele trei studii, afinitatile genetice ale Ashkenazimului sunt foarte asemanatoare cu afinitatile italienilor, Ashkenazim fiind de obicei putin mai indepartat de celelalte populatii, asa cum se poate astepta de la o populatie care a suferit o deriva genetica mai puternica. Prin urmare, este putin probabil ca Ashkenazim sa fie un amestec de oameni din diferite locuri din bazinul mediteranean, cu exceptia cazului in care italienii din zilele noastre nu numai ca au absorbit contributiile genetice straine, dar constituie de fapt un astfel de amestec, si acest lucru pare putin probabil. Corelatia foarte ridicata (0,926) intre distantele genetice ale EEJ si distantele geografice, atunci cand acestea din urma sunt calculate de la Roma, sprijina, de asemenea, originea EEJ din Italia sau vecinatatea acesteia si nu doar din bazinul mediteranean. Asemanarea cu italienii a fost evidenta si atunci cand mai multe populatii italiene din provincii diferite au fost incluse intr-o comparatie bazata pe markeri autosomali clasici. Majoritatea populatiilor italiene au fost mai aproape de EEJ decat toate celelalte populatii (datele nu sunt aratate). 926) intre distantele genetice ale EEJ si distantele geografice, atunci cand acestea din urma sunt calculate de la Roma, sprijina, de asemenea, originea EEJ din Italia sau vecinatatea sa si nu doar din bazinul mediteranean. Asemanarea cu italienii a fost evidenta si atunci cand mai multe populatii italiene din provincii diferite au fost incluse intr-o comparatie bazata pe markeri autosomali clasici. Majoritatea populatiilor italiene au fost mai aproape de EEJ decat toate celelalte populatii (datele nu sunt aratate). 926) intre distantele genetice ale EEJ si distantele geografice, atunci cand acestea din urma sunt calculate de la Roma, sprijina, de asemenea, originea EEJ din Italia sau vecinatatea sa si nu doar din bazinul mediteranean. Asemanarea cu italienii a fost evidenta si atunci cand mai multe populatii italiene din provincii diferite au fost incluse intr-o comparatie bazata pe markeri autosomali clasici. Majoritatea populatiilor italiene au fost mai aproape de EEJ decat toate celelalte populatii (datele nu sunt aratate).

Comentariile mele despre lucrarile lui Atzmon et al. [53] si Behar si colab. [54] sunt in discutie. Studierea haplotipurilor autosomale va contribui intr-adevar la dezvaluirea stramosilor populatiilor, dar pentru a obtine cunostinte semnificative, ar trebui sa studiem cel putin mai multe loci si sa ne asiguram ca dimensiunile esantionului sunt adecvate, acest lucru poate presupune mai mult efort decat studierea SNP-urilor unice si nu sunt sigur ca afinitatile dintre populatii vor fi infatisate mai precis. Am schimbat frazarea in Metode pentru a face mai clar faptul ca formula lui Reynolds si colab. a fost folosit doar pentru calculul arborelui.

Raportul revizorului 2

Kateryna Makova, Departamentul de Biologie, Universitatea Penn State, Pennsylvania SUA.

Acesta este un manuscris interesant care prezinta rezultate intrigante. Am doar cateva comentarii:

1. 1.

   Introducerea este foarte scurta, in timp ce discutia este lunga. Va propun sa treceti partile din Discutie la Introducere.

2. 2.

   Unele dintre afirmatiile din Discutie sunt prea puternice. Nu sunt de acord cu afirmatiile despre „distantele genetice Y cromozomiale eronate”, „ambii markeri uniparentali nu trebuie folositi pentru a-si urmari originea”, „markerii uniparentali fiind nesiguri”. Autorul ar trebui sa le modifice.

Raspunsul autorului

Am mutat paragraful din istoria EEJ la Introducere. Versiunea actualizata revizuita a lucrarii include o noua comparatie bazata pe mtDNA. Sustin ca adauga mai multa greutate afirmatiei mele ca markerii uniparentali nu ar trebui folositi pentru a urmari originea EEJ. In niciun caz nu am vrut sa spun ca markerii uniparentali sunt intotdeauna nesiguri; pentru a-l clarifica am modificat propozitia relevanta in discutie. Intr-adevar, din exemplele demografice pe care le dau in Discutie, se pare ca markerii uniparentali pot fi folositi pentru a studia originile evreilor irakieni si ale evreilor yemenite.

Raportul revizorului 3

Qasim Ayub, The Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Marea Britanie (nominalizat de Dan Graur, Departamentul de Biologie si Biochimie, Universitatea din Houston, Houston, SUA).

Lucrarea de Zoossmann-Diskin intitulata „Originea evreilor din Europa de Est revelata de polimorfismele cromozomiale autosomale si sexuale” exploreaza polimorfismele autosomale si cromozomiale sexuale din sase populatii evreiesti folosind date publicate anterior si aditionale nepublicate anterior. Autorul concluzioneaza ca populatiile evreiesti examinate nu au o origine comuna si ca evreii din Europa de Est sunt mai apropiati de populatia italiana.

Preocuparea mea majora este alegerea markerilor si a populatiilor utilizate in acest studiu. Autorul a analizat 17 loci autosomali, incluzand 9 variante electroforetice de proteine ​​polimorfe in care s-a asumat genotipul. Desi adesea fenotipurile se coreleaza cu genotipurile presupunand ca acestea pot duce la rezultate eronate. Din restul de 8 nu este clar daca aceleasi esantioane au fost genotipate, intrucat numerele de esantion pentru fiecare locus variaza foarte mult (tabele suplimentare 2-4).

Autorul foloseste, de asemenea, frecventele hapologrupului Y si arata o diagrama de scalare multidimensionala a matricei de distanta genetica cromozomiala Y Cu toate acestea, datele suplimentare (tabelul suplimentar 5) enumera o nomenclatura invechita pentru haplogrupuri Y, deoarece marcatorul M78 nu mai este considerat parte a haplogrupului E3b1. Ar fi mai indicat sa enumeram care sunt markerii folositi pentru a desemna grupurile haplogrupuri pentru a se asigura ca sunt comparabile. In plus, haplogrupurile selectate pentru aceste analize nu ofera o rezolutie filogenetica pentru a detecta in mod fiabil sub-structura genetica masculina din Orientul Mijlociu. Omiterea studiilor recente ADNm (Behar si colab., 2008, PLoS One 3: e2062) este surprinzatoare, la fel si utilizarea unui singur loc cromozomial X (DYS44) pentru a face concluzii largi despre relatia genetica.

Dovezi actuale, sustinute mai recent de doua studii majore efectuate pe populatii evreiesti (Atzmon si colab., Am JH Genetics 86: 850-859; Behar si colab., Natura doi: 10.1038), folosind un set de date mult mai mare, demonstreaza clar o genetica comuna fir care leaga diversele populatii evreiesti Mizrahi, sefardice si Ashkenazi cu populatiile din Levant si Orientul Mijlociu. Ashkenazi prezinta o componenta europeana, dar aceasta este impartasita cu multe populatii din Europa de Est si de Sud. Aceste studii contrazic concluzia autorului si demonstreaza puterea de a utiliza markeri nepartinitori si populatii gazda in regiunile geografice corespunzatoare pentru a aborda probleme precum relatia genetica intre populatiile evreiesti si non-evreiesti

Raspunsul autorului

Nu sunt sigur ce inseamna Dr Ayub prin „asumat”, dar banuiesc ca el inseamna ceva precum relatiile dintre fenotip si genotip in anumite grupe de sange, in care una (sau mai multe) alele este dominanta asupra celuilalt si frecventele genice ale alelele trebuie sa fie deduse din fenotipurile asumandu-se echilibrul Hardy-Weinberg. In astfel de cazuri, pot exista intr-adevar erori in frecventele genelor. Markerii electroforetici proteici sunt complet diferiti. Nimic nu este dedus! Asa cum s-a mentionat in Metode, toti markerii electroforetici proteici din acest studiu reprezinta un SNP la nivelul ADN-ului. Acest SNP determina o schimbare de aminoacizi care poate fi detectata la nivel de proteine. Ambele alele sunt vizualizate direct pe gel in acelasi mod in care ambele alele ale unui RFLP sunt vizualizate direct pe gel. Frecventele genice sunt determinate in ambele cazuri prin numararea simpla a genelor, iar rata de eroare in electroforeza proteinelor nu este mai mare decat in ​​studiile ADN. Nu este necesara introducerea acelorasi probe pentru toate polimorfismele, deoarece unitatea de studiu este populatia, nu individul. Se pot folosi polimorfisme tipizate de diferiti cercetatori folosind diferite probe si le pot combina pentru a crea un profil genetic al fiecarei populatii. Tastati toate polimorfismele pe acelasi esantion nu aduc mai multa credibilitate studiului. Intr-adevar, lucrarile de renume care au folosit markeri autosomali clasici pentru a infatisa afinitatile genetice ale populatiilor umane s-au bazat pe multe esantioane diferite dati de multi cercetatori diferiti [56, 57]. Nu este necesara introducerea acelorasi probe pentru toate polimorfismele, deoarece unitatea de studiu este populatia, nu individul. Se pot folosi polimorfisme tipizate de diferiti cercetatori folosind diferite probe si le pot combina pentru a crea un profil genetic al fiecarei populatii. Tastati toate polimorfismele pe acelasi esantion nu aduc mai multa credibilitate studiului. Intr-adevar, lucrarile de renume care au folosit markeri autosomali clasici pentru a infatisa afinitatile genetice ale populatiilor umane s-au bazat pe multe esantioane diferite tipate de multi cercetatori diferiti [56, 57]. Nu este necesara introducerea acelorasi probe pentru toate polimorfismele, deoarece unitatea de studiu este populatia, nu individul. Se pot folosi polimorfisme tipizate de diferiti cercetatori folosind diferite probe si le pot combina pentru a crea un profil genetic al fiecarei populatii. Tastati toate polimorfismele pe acelasi esantion nu aduc mai multa credibilitate studiului. Intr-adevar, lucrarile de renume care au folosit markeri autosomali clasici pentru a infatisa afinitatile genetice ale populatiilor umane s-au bazat pe multe esantioane diferite dati de multi cercetatori diferiti [56, 57]. Tastati toate polimorfismele pe acelasi esantion nu aduc mai multa credibilitate studiului. Intr-adevar, lucrarile de renume care au folosit markeri autosomali clasici pentru a infatisa afinitatile genetice ale populatiilor umane s-au bazat pe multe esantioane diferite dati de multi cercetatori diferiti [56, 57]. Tastati toate polimorfismele pe acelasi esantion nu aduc mai multa credibilitate studiului. Intr-adevar, lucrarile de renume care au folosit markeri autosomali clasici pentru a infatisa afinitatile genetice ale populatiilor umane s-au bazat pe multe esantioane diferite dati de multi cercetatori diferiti [56, 57].

Nomenclatura din tabelul suplimentar pentru cromozomii Y a fost actualizata. In urma publicarii studiului de Behar si colab. [54] a fost posibil sa se adauge mai multe populatii evreiesti la analiza cromozomilor Y si sa creasca numarul de cromozomi pentru populatiile evreiesti. Aceasta crestere a venit totusi in detrimentul rezolutiei, deoarece Behar et al. [54] au utilizat mai putine haplogrupuri in analiza lor. In consecinta, numarul de haplogrupuri a fost redus de la 15 in versiunea initiala la 14 in aceasta versiune revizuita. As fi fost mai fericit daca datele disponibile despre populatiile evreiesti ar fi permis o rezolutie mai mare pentru a detecta in mod fiabil sub-structura genetica masculina din Orientul Mijlociu, dar, deoarece aceasta lucrare se refera la afinitatile genetice ale EEJ, nivelul actual este suficient. Opera lui Behar si colab. din 2008 a contribuit esential la crearea matricei mtDNA asa cum se poate observa in tabelul 7 din fisierul suplimentar 1. Nu a fost necesara citarea ei anterior, deoarece nu continea nicio analiza de distanta genetica care sa poata clarifica si mai mult originea EEJ. Sunt surprins de surprinderea doctorului Ayub in ceea ce priveste utilizarea unui singur loc cromozomial X. Ar fi fost mai bine sa utilizam multi loci cromozomali X, dar chiar si utilizarea lociilor unice este avantajoasa, deoarece sunt sigur ca chiar si doctorul Ayub ar fi de acord cu privire la celelalte doua loci unice pe care le folosesc, cromozomul Y care nu se recombina (NRY) si mtDNA.

Dupa cum s-a scris in Discutie, matricile genetice ale distantei lui Atzmon si colab. [53] si Behar si colab. [54] nu contrazic rezultatele mele, ci le consolideaza. Resping complet afirmatia doctorului Ayub potrivit careia markerii sau populatiile pe care le-am folosit sunt partinitoare si las pe cititor sa judece, unde se afla exact prejudecata.